Khác với nhiều đồng đội, Bảo Toàn không phải cầu thủ trưởng thành từ Học viện Hoàng Anh Gia Lai, mà anh đến từ lớp Năng khiếu của đội chủ sân Pleiku. Không tham gia vào những khoá huấn luyện ban đầu, và cũng chỉ mới được tập trung cùng đội U19 HAGL một năm về trước. Thế nhưng Bảo Toàn đã khiến cho huấn luyện viên Guillaume Graechen phải ngạc nhiên về sự tiến bộ nhanh chóng cũng như những tố chất của mình.

Với những gì đang có, Trần Bảo Toàn đang là một gương mặt trẻ rất giàu triển vọng của bóng đá nước nhà. Và nếu có thể phát huy hết tiềm năng của mình, Bảo Toàn có thể sẽ trở thành một cầu thủ lớn trong tương lai.